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11月8日 (火)

場所 工学部3号館 342講義室
連絡先 計算科学連携教育研究センター

  16:30 ~17:30
Speaker
吉井範行
名古屋大学 計算科学連携教育研究センター
Title
長距離相互作用を有する大規模系の分子動力学計算
―生体膜・ミセル+薬物系の熱力学的安定性
Abstract
生体膜やミセルといった両親媒性分子集合体への薬物の結合解離過程は、薬効の発現や薬物搬送を考えるうえで極めて重要である。
演者らはこれまで分子動力学法に基づく自由エネルギー計算により生体膜やミセルと薬物との相互作用を評価する手法を提案してきた。
本講演ではそれらの結果を示すとともに、これらの計算に用いた演者らが開発中の高並列汎用分子動力学計算ソフトウェア「MODYLAS」についても合わせて紹介する。神戸に導入されつつあるスパコン「京」におけるパフォーマンスについても触れたい。